La plateforme est équipée d’un Chromium iX compatible avec l’ensemble des applications Single Cell proposées par 10X Genomics : Gene expression Flex, Gene Expression, Immune Profiling, Multiome, ATAC ==> Pour plus d’informations visitez le site 10X Genomics
Nous réalisons la préparation des librairies, le séquençage et l’analyse primaire des données avec Cell Ranger.
La préparation et fixation (le cas échéant) des suspensions cellulaires est assurée par le porteur de projet.
La préparation et fixation (le cas échéant) des suspensions de noyaux peut être réalisée par la plateforme.
La qualité de la suspension cellulaire/noyaux est déterminante pour le succès du projet ScRNAseq/SnRNAseq.
La présence de débris et de cellules mortes impacte le taux d’encapsulation, le taux de viabilité cellulaire doit être supérieur à 70% ==> Consultez les recommandations (Product Support)
Le nombre de cellules en entrée dépend du nombre de cellules que vous souhaitez analyser, le taux d’encapsulation moyen est de 40-60%.
Nos équipements de tri cellulaire (GentleMacs, Tyto, MacsQuant16) sont accessibles pour la préparation de vos échantillons et leur contrôle qualité ==> Réserver ou Nous contacter
Contactez nous pour planifier vos expériences.
La plateforme propose également de réaliser vos expériences de Single Cell/Nuclei Whole Transcriptome, Immune Profiling et screening CRISPR avec la technologie Evercode de Parse Biosciences basée sur le split-pool combinatorial barcoding.
Nous réalisons la préparation des librairies, le séquençage et l’analyse primaire des données avec Parse Biosciences-Pipeline.
La préparation et fixation des suspensions cellulaires est assurée par le porteur de projet.
La préparation et fixation des suspensions de noyaux peut être réalisée par la plateforme.
La qualité de la suspension cellulaire/noyaux est déterminante pour le succès du projet ScRNAseq/SnRNAseq.
La présence de débris et de cellules mortes impacte le barre-coding, le taux de viabilité cellulaire doit être supérieur à 70% ==> Consultez les recommandations pour la préparation de cellules ou de noyaux (Evercode Fixation)
Nos équipements de tri cellulaire (GentleMacs, Tyto, MacsQuant16) sont accessibles pour la préparation de vos échantillons et leur contrôle qualité ==> Réserver ou Nous contacter
Contactez nous pour planifier vos expériences.
La plateforme propose également de réaliser vos expériences de Single Cell/Nuclei Whole Transcriptome avec la solution Illumina Single Cell 3' RNA Prep basée sur la technologie PIPseq.
Nous réalisons la préparation des librairies, le séquençage et l’analyse primaire des données avec DRAGEN.
La préparation et fixation (le cas échéant) des suspensions cellulaires est assurée par le porteur de projet.
La préparation et fixation (le cas échéant) des suspensions de noyaux peut être réalisée par la plateforme.
La qualité de la suspension cellulaire/noyaux est déterminante pour le succès du projet ScRNAseq/SnRNAseq.
La présence de débris et de cellules mortes impacte le barre-coding, le taux de viabilité cellulaire doit être supérieur à 70% ==> Consultez les recommandations pour la préparation de cellules ou de noyaux (Single Cell Prep Documentation)
Nos équipements de tri cellulaire (GentleMacs, Tyto, MacsQuant16) sont accessibles pour la préparation de vos échantillons et leur contrôle qualité ==> Réserver ou Nous contacter
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