L’analyse primaire des données NGS est réalisée par la plateforme : démultiplexage des données, contrôle qualité des séquences. Pour chaque échantillon, les fichiers FASTQ des données brutes ainsi que les données démultiplexées et un rapport qualité sont mis à disposition du porteur de projet. Les données brutes sont conservées pendant un an après mise à disposition sur les serveurs de l’Université de Caen.
Les analyses secondaires et tertiaires des données peuvent également être réalisées par la plateforme qui est titulaire de licences logiciels dédiées :
- Analyse de données Multiomiques ==> Illumina Connected Multiomics
- Analyse de données d’Imagerie Multiplexe MACSima ==> MACS iQ View
- Analyse de données de dosage de biomarqueurs Olink ==> Olink NPX Map et NPX Signature
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